申请物理污染防治工程乙级资质时，现场审核的重点可能包括以下几个方面：
企业基本信息核实：
审查企业的营业执照、组织机构代码证、税务登记证等，确认企业基本信息与申请资料一致，且经营范围符合资质申请要求。
办公场所与设施考察：
检查企业是否有固定、独立的办公场所，办公环境和设施是否满足设计业务开展的需要，包括办公设备、设计软件、实验设备等。
技术人员配备核查：
现场核实技术人员的在岗情况，查看技术人员的职称证书、注册证书原件，确认企业是否按照资质标准配备了足够的、符合要求的专业技术人员。
工程业绩审查：
查阅已完成项目的相关资料，如设计合同、设计图纸、施工图纸、验收报告等，核实企业的工程业绩是否真实有效，是否达到乙级资质标准要求。
管理体系运行情况：
检查企业是否建立了完善的质量管理体系、安全生产管理体系、技术档案管理制度等，查看相关文件记录，以及体系运行的实际状况。
设备设施检查：
现场查看企业所拥有的物理污染防治相关设备设施，确认设备的性能、数量和状态，是否满足乙级资质的设备配置要求。
财务状况考察：
虽然不一定在现场审核时深入检查，但资质申请往往要求企业提供财务审计报告，审核员可能会关注企业的财务状况是否稳健，是否符合资质标准对注册资本、净资产等财务指标的要求。
现场访谈：
审核人员可能会随机挑选部分技术人员进行访谈，了解其工作职责、项目参与情况，以及对相关技术规范和标准的掌握程度。